Законопроектом передбачається закріпити за бюджетом Автономної Республіки Крим та обласними бюджетами податок на прибуток підприємств (крім підприємств комунальної власності), а також за бюджетом Автономної Республіки Крим - акцизний збір з вироблених в Україні товарів (крім нафтопродуктів і транспортних засобів) як джерела доходів, що враховуються при визначенні міжбюджетних трансфертів та не визначати з бюджету Автономної Республіки Крим передачі коштів до державного бюджету. А плату за землю пропонується перенести до доходів, що не враховуються при визначенні міжбюджетних трансфертів.
На засіданні Комітету йшлося про те, що ці пропозиції повинні розглядатися в комплексі з іншими змінами до бюджетного законодавства, які розроблятимуться відповідно до Програми діяльності Кабінету Міністрів України, з метою збалансування міжбюджетних відносин.
На думку членів Комітету, суперечливою є запропонована норма, згідно із якою доходи, що перевищують їх розрахунковий обсяг, який враховується при розрахунку міжбюджетних трансфертів, направляються для фінансування з бюджету Автономної Республіки Крим витрат, пов’язаних з реалізацією особливостей Автономної Республіки Крим. Така пропозиція порушує принцип єдності бюджетної системи України, згідно з яким єдність бюджетної системи України забезпечується єдиною правовою базою, єдиним регулюванням бюджетних відносин, єдністю порядку виконання бюджетів (стаття 7 Бюджетного кодексу України). При цьому, запропонована норма не дає чіткого уявлення щодо напрямів використання таких коштів.