Комітет отримав низку пропозицій і зауважень щодо невідповідності даного законопроекту чинному законодавству. Так, Головне юридичне управління звертає увагу на те, що окремі положення законопроекту не узгоджуються з іншими законами України. Міністерство освіти і науки України пропонує вилучити значну частину статей, які дублюють спеціальні закони у сфері освіти, науки, охорони здоров'я, культури та ін.
На думку членів Комітету, надання статусу "національного університету" у системі освіти далеко не завжди себе виправдовує. З 82-х державних вищих навчальних закладів, яким було надано такий цей статус, деякі на сьогодні втратили темпи розвитку і мають показники діяльності, що не відповідають вимогам часу. Народні депутати вважають, що слід переглянути методологію визначення рейтингу і надання такого статусу закладам (установам) України.
Члени Комітету також зазначили, що включення до назви закладу прикметника "національний" не може бути свідченням рейтингу вище за інші аналогічні заклади, а також підставою для надання будь-яких пільг.
Комітет підтримав позицію Кабінету Міністрів стосовно недоцільності прийняття законопроекту про національний заклад (установу) України і вважає за доцільне зняти зазначений законопроект з розгляду.
Члени Комітету наголосили, що такі дії дадуть змогу запобігти прийняттю недосконало підготовленого закону та надати можливість вирішення проблеми встановлення рейтингу закладів (установ) з відповідними правами і обов'язками в процесі подальшого системного вивчення питання.