Марлен Нурійович Абдулгафаров народився 26 вересня 1965 року в місті Андижан Республіки Узбекистан — у місцях депортації кримськотатарського народу.
У 1982 році закінчив середню школу № 35 у місті Андижан. Упродовж 1983–1985 років проходив строкову військову службу. Згодом навчався у Київському автомобільно-дорожньому інституті, де здобув кваліфікацію інженера-механіка.
У 1989 році Марлен Абдулгафаров переїхав до Криму. Працював на різних посадах у Сімферополі та Бахчисарайському районі. Значну частину свого професійного життя присвятив службі в органах внутрішніх справ. Багато років працював у системі карного розшуку Головного управління Міністерства внутрішніх справ України в Автономній Республіці Крим. До тимчасової окупації півострова вийшов на пенсію.
Марлен Абдулгафаров був активним учасником кримськотатарського національного руху, відстоював права свого народу та підтримував збереження його національної ідентичності. У 2013 році його обрали членом Бахчисарайського регіонального меджлісу.
Після тимчасової окупації Криму російською федерацією Марлен залишався відданим Україні та продовжував підтримувати кримськотатарський національний рух.
З квітня 2023 року він працював в Апараті Верховної Ради України на посаді помічника-консультанта народного депутата України Ахтема Чийгоза.
Під час повномасштабної війни Марлен Абдулгафаров став на захист України. Він проходив військову службу у складі 48-го окремого штурмового батальйону імені Номана Челебіджіхана. Мав військове звання сержанта, був заступником командира 5-ї штурмової роти та очолював штурмову групу.
Марлен виконував складні та небезпечні бойові завдання. Командування довіряло йому операції, які потребували особливої витримки та рішучості.
Останнім бойовим завданням штурмової групи під командуванням Марлена Абдулгафарова стала операція зі звільнення одного з населених пунктів Донецької області. Під час її виконання українські військові взяли в полон п’ятьох російських військовослужбовців. Марлен дістав поранення, проте разом із побратимами успішно повернувся після виконання завдання.
21 грудня 2024 року Марлен Абдулгафаров відчув сильний біль у серці. Врятувати воїна лікарям не вдалося.
24 грудня 2024 року в мечеті Кримськотатарського культурного центру «Birlik» у селі Чайки Київської області відбувся дженазе-намаз за захисником України. Поховали Марлена Абдулгафарова на мусульманській частині місцевого кладовища.
Марлен Абдулгафаров був одружений, мав двох синів і доньку.
Марлену Абдулгафарову назавжди залишилося 59 років.