Положення Протоколу (реєстр № 0052) передбачають вжиття різноманітних заходів на національному й міжнародному рівні, спрямованих на захист та невиснажливе використання природних ресурсів і збереження культурної спадщини Чорноморських країн для сучасних і майбутніх поколінь. Наявний науковий потенціал фахівців в Україні є достатнім для кваліфікованого забезпечення виконання нею міжнародних зобов’язань в рамках Протоколу.
Діяльність в рамках Протоколу буде практичним внеском в реалізацію Договору про заборону розміщення на дні морів та океанів ядерної зброї та інших видів зброї масового знищення, Конвенції про запобігання забруднення моря скиданням відходів та інших матеріалів, Конвенції про захист Чорного моря від забруднення, Концепції охорони та відтворення навколишнього природного середовища Азовського і Чорного морів.
Крім того, ратифікація Україною Протоколу дозволить їй отримувати фінансову допомогу у вигляді грантів, технічних засобів, а також залучати інші кошти міжнародних фондів і організацій та спрямовувати їх на розв'язання комплексу екологічних, економічних, науково-технічних, організаційних проблем щодо збереження біо- та ландшафтного різноманіття Чорного моря.