Президент України пропонує відхилити закон (реєстр. №0839), оскільки Програма, про яку у ньому йдеться, містить заходи, які можуть фінансуватися за рахунок інших бюджетних програм, передбачених Державним бюджетом України. Також у законі відсутні розрахунки очікуваних результатів виконання програми та її ефективності, а також фінансування Програми, у тому числі за рахунок коштів Державного бюджету з розбивкою за роками, що не дасть змоги врахувати її завдання, показники та заходи під час розроблення проекту Державного бюджету України на відповідний рік.
З приводу зауважень Президента України зазначалося, що Загальнодержавна програма ведення сільськогосподарського виробництва на території, що зазнала радіоактивного забруднення внаслідок Чорнобильської катастрофи, на 2007-2016 роки має спеціалізований й комплексний характер, передбачає різноманітні заходи організаційного, технологічного, економічного, правового характеру, що мають вирішувати проблему розвитку сільськогосподарського виробництва на радіоактивно забрудненій території. У силу своєї комплексності вона неодмінно має “пересікатися” у визначенні тих чи інших заходів з іншими програмами, що не тільки є її вадою, а навпаки, дозволяє максимально врахувати усі чинники, які впливають на ефективність державної політики у даній сфері. Безумовно, при опрацюванні проекту Державного бюджету України на відповідний рік має бути забезпечений взаємозалік видатків на реалізацію заходів, що передбачені цією Програмою та іншими програмами, що є нормальною практикою бюджетного процесу.
З приводу ж того, що у Законі відсутні відповідні розрахунки, зазначимо наступне. Очікувані результати виконання програми наведені у її розділі Х, а також у Додатку 1. Орієнтовний поетапний (за роками ) обсяг фінансування відповідних заходів визначається у Додатку 2. Встановлено також, що центральний орган виконавчої влади з питань аграрної політики має щорічно подавати обґрунтування обсягів робіт та обсягів фінансування щодо даної Програми до проекту Державного бюджету України на відповідний рік з урахуванням пропозицій центральних та місцевих органів виконавчої влади.