Прийнятий Верховною Радою України 16 березня 2006 року Закон України "Про внесення змін до Закону України "Про охорону прав на сорти рослин" (реєстр. №0836). Президент України не підписав через невідповідність окремих його положень Конституції України та законам України, які є базовими у цій сфері.
Президент України, зокрема, пропонує вилучити абзаци четвертий - шостий частини 1 статті 9 Закону України "Про охорону прав на сорти рослин", згідно з якими Установа у сфері охорони прав на сорти рослин "створює Державну інспекцію з охорони прав на сорти рослин як власний структурний підрозділ та доручає їй здійснення контролю за дотриманням законодавства у сфері охорони прав на сорти рослин". Ця пропозиція аргументується тим, що вирішення питань щодо структури будь-яких органів у системі органів виконавчої влади не належить до повноважень парламенту, передбачених статтею 85 Конституції України.
Друга Пропозиція Президента України стосується виключення положення, відповідно до якого Установа забезпечує формування цільових фондів сприяння охороні інтелектуальної власності на сорти рослин в Україні та розвитку державної системи охорони прав на сорти рослин за рахунок коштів зацікавлених суб'єктів підприємницької діяльності всіх форм власності, благодійних внесків юридичних та фізичних осіб резидентів та нерезидентів, ресурсів фінансово-кредитної сфери (банківського кредитування, коштів інвестиційних, пенсійних фондів, страхових інвестиційних компаній), грантів, іноземного капіталу та міжнародної технічної допомоги. Оскільки, наведене положення не узгоджується з частиною восьмою статті 13 Бюджетного кодексу України, відповідно до якої не допускається створення позабюджетних фондів органами державної влади, органами влади Автономної Республіки Крим, органами місцевого самоврядування та іншими бюджетними установами, та статтею 3 Закону України "Про джерела фінансування органів державної влади", якою органам державної влади забороняється створювати позабюджетні фонди, мати позабюджетні спеціальні рахунки та використовувати кошти, одержані за здійснення функцій держави, що передбачають видачу дозволів (ліцензій), сертифікатів, посвідчень, проведення реєстрацій та інших дій на платній основі, в будь-який інший спосіб, крім зарахування таких коштів до Державного бюджету України.
Комітет погодився з обома пропозиціями Президента України та вносить на розгляд Верховної Ради Закон України "Про внесення змін до Закону України "Про охорону прав на сорти рослин" для прийняття його з урахуванням пропозицій Президента України.