Зокрема, на засіданні зазначалося, що реалізація пріоритетних напрямів науки і техніки здійснювалася шляхом виконання державних наукових та науково-технічних програм (ДНТП) та державного замовлення на створення наукової та науково-технічної продукції.
Члени Комітету наголосили, що частка коштів на ДНТП у загальному обсязі коштів, що виділялися з Державного бюджету України на науку, постійно зменшувалась від 0,6 % у 2003 році до 0,3% у 2006 році, що у 100 разів менше, ніж передбачено законом. Це, на думку народних депутатів, зумовило вкрай низьку ефективність таких програм, стало однією з основних причин практично повної втрати вплину держави на напрями інноваційного розвитку, що суперечить світовим тенденціям, пов'язаним із побудовою суспільства і економіки, що базується на знаннях.
На засіданні Комітету йшлося про те, що протягом 2003 -2007 років в Україні реалізувалися наукові частини 287 державних цільових програм і програм розвитку окремих регіонів, галузей економіки та сфер суспільного життя, Державним замовником яких виступали різні центральні органи виконавчої влади як головні розпорядники бюджетних коштів.
Постановою Верховної Ради України «Про дотримання законодавства щодо розвитку науково-технічного потенціалу та інноваційної діяльності» уряду України рекомендовано переглянути існуючі державні цільові програми, що фінансуються з Державного бюджету України, та упорядкувати їх відповідно до пріоритетних напрямів, визначених законом.
Наслідком цього кількість програм та головних розпорядників бюджетних коштів було зменшено з 90 у 2003 році до 43 у 2007 році та з 23 у 2003 році до 16 у 2007 році, відповідно. Разом з тим видатки на фінансування наукових частин державних цільових програм по відношенню до загального обсягу фінансування науки мають низький рівень.
Важливе значення у розробці пріоритетних напрямів розвитку науки і техніки, пріоритетних напрямів інноваційної діяльності, вважають члени Комітету, мають прогнозно-аналітичні дослідження. Кабінетом Міністрів України затверджено розроблену Міністерством освіти і науки та Національною академією наук Державну програму прогнозування науково-технічного та інноваційного розвитку на 2004 - 2006 роки. Державним замовником цієї програми визначено Міністерство освіти і науки України. На реалізацію завдань зазначеної Державної програми передбачалися кошти у розмірі 2,0 млн. грн., а реально виділено з Державного бюджету України за 2004-2006 роки лише 1 млн. грн.:
На засіданні також йшлося про те, що реалізація пріоритетного напряму "розвиток фундаментальних досліджень з найважливіших проблем природничих, суспільних і гуманітарних наук" здійснювалася Національною академією наук, галузевими академіями наук України та Державним фондом фундаментальних досліджень. Народні депутати, позитивно відзначаючи збільшення, починаючи з 2002 року, обсягів бюджетного фінансування академічної науки, звернули увагу на вкрай низький рівень бюджетного фінансування Державного фонду фундаментальних досліджень та фундаментальних досліджень у ВНЗ ІП-ІУ рівня акредитації, хоча відповідні рекомендації щодо цього були визначені Постановою Верховної Ради України "Про дотримання законодавства щодо розвитку науково-технічного потенціалу та інноваційної діяльності".
Рахунковою палатою України проводились перевірки ефективності "використання Національною академією наук України, Академією педагогічних наук України та Міністерством палива та енергетики України копі гін державного бюджету України, у тому числі тих, що спрямовувалися на реалізацію пріоритетних напрямів науки і техніки. У матеріалах перевірки наголошувалося на порушенні чинного законодавства та неефективному використанні коштів державного бюджету. Головною проблемою такою неефективного використання коштів визначено відсутність споживача науково) продукції та механізмів впровадження результатів фундаментальних наукових досліджень.
В підсумку обговорення Комітет інформацію Міністерства освіти і науки України щодо реалізації Закону "Про пріоритетні напрями розвитку науки і техніки" взяв до відома. Було визнано, що у 2002-2006 цього не було в повній мірі створено організаційних засад цілісної системи розробки та реалізації пріоритетних напрямів, належного розвитку програмно – цільового методу і конкуренції в науковій сфері, ефективної концентрації матеріально -]технічних, фінансових ресурсів щодо вирішенні актуальних проблем держави.
Комітет вважає, Кабінет Міністрів України, серед іншого, має вдосконалити структуру державних пріоритетів й систему формування та реалізації державних цільових наукових та науково-технічних програм, передбачити запровадження механізмів стимулювання залучення коштів регіональних бюджетів, міжнародних організацій та бізнесових структур до виконання завдань державних цільових наукових і науково-технічних програм та механізмів впровадження наукових результатів, у тому числі через державне замовлення на створення наукової і науково-технічної продукції. Розглянути питання про запровадження індикативного планування науково-технологічного та інноваційного розвитку в Україні.